Можно ли «на лету» менять настройки

Нельзя. Это небезопасно.

Если нужно немного поправить настройки нажмите на исходный поток, поправьте настройки, добавьте как новый поток нажав на кнопку "Добавить". И запланируйте остановку старого потока при помощи контекстного меню правой кнопкой мыши.